Yuwen Liu課題組簡介

Yuwen Liu，研究員、博士生導(dǎo)師。入選國家重大人才工程（青年）、廣東省高層次人才（青年）、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”領(lǐng)軍人才B類、深圳市高層次人才B類，深圳市“青年五四獎(jiǎng)?wù)隆鲍@得者。2006年于清華大學(xué)本科畢業(yè)，2014年在芝加哥大學(xué)取得博士學(xué)位。Yuwen Liu研究員在基因組和表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域有著十多年的科學(xué)研究經(jīng)歷，在學(xué)術(shù)研究上擅長開發(fā)實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，從非編碼調(diào)控區(qū)入手解析經(jīng)濟(jì)動(dòng)物復(fù)雜性狀的遺傳基礎(chǔ)，以及基于細(xì)胞調(diào)控線路設(shè)計(jì)的合成生物學(xué)育種。以第一作者（含并列第一）和通訊作者（含共同通訊）作者在Genome Biology，American Journal of Human Genetics, JACS, Bioinformatics等高水平雜志上共發(fā)表文章7篇，以共同作者在 Nature Genetics, Nature Communications 等高水平期刊發(fā)表十余篇文章，Google Scholar總引用1000多次。開發(fā)了首次直接測量定位全基因組高通量增強(qiáng)子的WHG-STARR-Seq、首次測定了上萬GWAS關(guān)聯(lián)性SNP對增強(qiáng)子功能影響的allele-specific STARR-Seq和首次將增強(qiáng)子、DNA變異整合分析拓展到新生突變的統(tǒng)計(jì)算法TADA-Annotation。在產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化上，開發(fā)了基于靶向二代測序的伴侶動(dòng)物基因檢測液相芯片，可以通過品系鑒定，遺傳病篩查和親緣關(guān)系鑒定提升遺傳改良效率，獲批三項(xiàng)國家專利，獲得產(chǎn)業(yè)投資400萬元進(jìn)行產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化。開發(fā)了基于超低覆蓋度全基因組測序數(shù)據(jù)的基因型分型計(jì)算方法，領(lǐng)導(dǎo)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了適用于二倍體農(nóng)業(yè)動(dòng)物和作物的高效低成本基因型分型和基因組選擇平臺，獲得首屆廣東省種業(yè)科技大比武總決賽十強(qiáng)，2021年深圳市創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽大鵬賽區(qū)農(nóng)業(yè)賽道第一名，并以此平臺依托基因組所孵化中農(nóng)芯躍分子育種公司?，F(xiàn)主持十四五國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題、國家自然科學(xué)青年科學(xué)基金項(xiàng)目、國家自然科學(xué)面上項(xiàng)目以及深圳科創(chuàng)委面上項(xiàng)目共4項(xiàng)，核心參與了廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研計(jì)劃共2項(xiàng)。

研究方向：

主要專注于開發(fā)新的實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的增強(qiáng)子定位和功能，非編碼區(qū)DNA變異如何通過影響增強(qiáng)子功能而影響生物性狀，以及如何通過人工設(shè)計(jì)調(diào)控增強(qiáng)子等調(diào)控元件改變生物性狀，方法具有普遍適用性，同時(shí)在解析豬產(chǎn)肉性狀遺傳機(jī)制解析中進(jìn)行深入應(yīng)用。具體研究方向包括：

1.結(jié)合基因型數(shù)據(jù)，表型數(shù)據(jù)和多組學(xué)功能注釋數(shù)據(jù)，解析GWAS信號和選擇進(jìn)化信號，從而挖掘影響性狀的重要調(diào)控元件和基因；

2.開發(fā)高通量實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，在動(dòng)物體內(nèi)和單細(xì)胞層面，鑒定影響增強(qiáng)子功能的DNA變異，并以此為切入點(diǎn)，挖掘影響性狀的關(guān)鍵基因；

3.開發(fā)實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方法，結(jié)合高通量調(diào)控元件數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)控元件序列底層邏輯的解析，優(yōu)化和設(shè)計(jì)新一代調(diào)控元件和細(xì)胞線路，通過合成生物學(xué)手段為性狀改良提供基因功能模塊；

4.開發(fā)低成本高密度的新一代基因型檢測方法，開發(fā)結(jié)合多組學(xué)數(shù)據(jù)和深度學(xué)習(xí)的全基因組選育方法和精細(xì)定位方法，協(xié)助推進(jìn)畜牧動(dòng)物品種選育和性狀改良。

課題組科研氣氛良好，指導(dǎo)老師會為每一個(gè)成員根據(jù)其自身興趣和特點(diǎn)設(shè)定培養(yǎng)方案，因材施教，并根據(jù)成員日后發(fā)展需求盡力提供各種資源。課題組成員團(tuán)結(jié)互助，凝聚力強(qiáng)，為新人的融入提供了友好且有力的支撐環(huán)境。再此，我們歡迎對國家民族發(fā)展有擔(dān)當(dāng)，對科技創(chuàng)新有熱情，愿意接受挑戰(zhàn)的志同道合之士加入我們。讓我們共同努力，立德立言，無問西東。

一、招聘崗位

根據(jù)團(tuán)隊(duì)工作需要，擬面向動(dòng)物遺傳育種與繁殖、生物信息學(xué)、功能基因組等方向招聘博士后1名、副研究員1名、科研助理2-3名、實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員2-3名。

二、應(yīng)聘條件

博士后

1.近三年內(nèi)獲得博士學(xué)位，年齡小于35歲。

2.近三年以第一作者或共同第一作者（排名第一位）發(fā)表中科院二區(qū)及以上的SCI論文至少1篇。有良好的獨(dú)立思考能力和英文能力。

3.對科研有濃厚的興趣，具有科研創(chuàng)新能力，勤于思考，能獨(dú)立開展課題研究，學(xué)術(shù)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，善于團(tuán)隊(duì)合作。

4.熟悉分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)，具備多組學(xué)文庫構(gòu)建研究經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先考慮。

5. 可選擇方向包括：（1）產(chǎn)生多組學(xué)數(shù)據(jù)解析生豬經(jīng)濟(jì)性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。（2）開發(fā)和用高通量方法定量海量調(diào)控元件活性，探索調(diào)控元件的時(shí)空特異性以及和環(huán)境的互作，并與生信分析人員合作通過人工智能手段設(shè)計(jì)符合需求的調(diào)控元件和細(xì)胞調(diào)控線路。（3）在動(dòng)物體內(nèi)和單細(xì)胞層面，開發(fā)高通量調(diào)控元件活性定量方法，與生信分析人員合作結(jié)合群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)解析復(fù)雜性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。（4）開發(fā)方法高通量定量植物調(diào)控元件活性，通過優(yōu)化表達(dá)載體，優(yōu)化植物底盤生產(chǎn)高附加值蛋白的效率。

副研究員

1.近三年以第一作者或共同第一作者（排名第一位）發(fā)表中科院一區(qū)及以上的SCI論文至少2篇。

2.對設(shè)計(jì)課題和申請項(xiàng)目有充足的經(jīng)驗(yàn)。

3.對科研有濃厚的興趣，具有科研創(chuàng)新能力，勤于思考，能獨(dú)立開展課題研究，學(xué)術(shù)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，善于團(tuán)隊(duì)合作。有良好的溝通能力和中英文科技寫作能力。

4.可選擇方向包括：（1）產(chǎn)生多組學(xué)數(shù)據(jù)解析生豬經(jīng)濟(jì)性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。（2）開發(fā)和利用高通量方法定量海量調(diào)控元件活性，探索調(diào)控元件的時(shí)空特異性以及和環(huán)境的互作，并與生信分析人員合作通過人工智能手段設(shè)計(jì)符合需求的調(diào)控元件和細(xì)胞調(diào)控線路。（3）在動(dòng)物體內(nèi)和單細(xì)胞層面，開發(fā)高通量調(diào)控元件活性定量方法，與生信分析人員合作結(jié)合群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù)解析復(fù)雜性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。（4）開發(fā)方法高通量定量植物調(diào)控元件活性，通過優(yōu)化表達(dá)載體，優(yōu)化植物底盤生產(chǎn)高附加值蛋白的效率。

科研助理（基因組選擇或生信品種鑒定）

1. 具有碩士研究生及以上學(xué)歷，有經(jīng)驗(yàn)本科亦可，專業(yè)包含但不限于生物信息學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、生物學(xué)等，具有相關(guān)工作經(jīng)驗(yàn)學(xué)歷可放寬條件。

2.具有良好的理解能力，良好的編程能力，認(rèn)同并熱愛基因組學(xué)研究或者算法開發(fā)工作。

3.以主要參與人完成一款生物信息學(xué)（或其他學(xué)科）算法軟件者優(yōu)先；發(fā)表方法學(xué)學(xué)術(shù)論文者優(yōu)先。

4.基因組選擇方向：負(fù)責(zé)多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析，負(fù)責(zé)基因組選擇方法開發(fā)；或生信品種鑒定方向：負(fù)責(zé)利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行品種鑒定，負(fù)責(zé)品種鑒定相關(guān)分析方法及流程研發(fā)。

5.完成上級交付的其它相關(guān)工作。

實(shí)驗(yàn)室技術(shù)員

1.具有碩士研究生及以上學(xué)歷，有經(jīng)驗(yàn)者本科亦可。

2.熟練掌握pcr分子實(shí)驗(yàn)技術(shù)，熟悉二代測序技術(shù)。

3.精通常見高通量建庫原理，流程，熟悉常規(guī)建庫方法。

4.負(fù)責(zé)二代測序項(xiàng)目的建立工作；優(yōu)化開發(fā)，逐步建立高效低價(jià)的自動(dòng)化建庫流程；負(fù)責(zé)相關(guān)設(shè)備的保養(yǎng)與維護(hù)；負(fù)責(zé)NGS相關(guān)檢測服務(wù)和產(chǎn)品研發(fā)。

5.完成上級交付的其它相關(guān)工作。

三、薪資待遇

博士后

1. 按照深圳市相關(guān)規(guī)定，博士后在站期間享受在站博士后生活補(bǔ)貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)。

2. 按照研究所的相關(guān)規(guī)定提供博士后的工資、五險(xiǎn)一金和績效待遇。

3. 符合條件的，可申請“博士后創(chuàng)新人才支持計(jì)劃”、“博士后國際交流計(jì)劃派出項(xiàng)目、引進(jìn)項(xiàng)目”、廣東省海外博士后人才支持項(xiàng)目、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士后“優(yōu)農(nóng)計(jì)劃”，在站期間可申報(bào)“中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院優(yōu)秀博士后”評審，入選者給予獎(jiǎng)金獎(jiǎng)勵(lì)。

4. 博士后人員進(jìn)站后，可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶。

5. 符合條件的博士后可申請?jiān)u定專業(yè)技術(shù)資格。

6.深圳市對出站博士后留深工作、簽訂3年勞動(dòng)合同的，給予30萬元資助，用于科研投入或創(chuàng)業(yè)前期費(fèi)用。

7.提供良好的工作環(huán)境和充足的研究經(jīng)費(fèi)，配備研究需要的設(shè)備和儀器，科研方向給予較高自由度。

副研究員

1.出站博士后后優(yōu)先考慮，待遇為年薪稅前30-50萬元/年，同時(shí)可享受研究所其他非薪資類績效和獎(jiǎng)勵(lì)。

2.符合相關(guān)人才條件，可依托基因組所申請廣東省、深圳市人才生活補(bǔ)貼。

3.遴選入職后可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶。

4.遴選入職后，符合條件可依托掛靠研究中心開展科研工作。符合條件可申請中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年英才計(jì)劃培育項(xiàng)目，享受中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年英才計(jì)劃待遇。

科研助理

1. 7000~15000元/月，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個(gè)人具體條件確定。

2. 繳納深圳市五險(xiǎn)一金。

3. 提供良好的科研環(huán)境，有機(jī)會發(fā)表文章、推薦到國內(nèi)外知名高校和科研單位深造學(xué)習(xí)。

實(shí)驗(yàn)室技術(shù)員

1. 7000~15000元/月，最終數(shù)額將根據(jù)應(yīng)聘者個(gè)人具體條件確定。

2. 繳納深圳市五險(xiǎn)一金。

3. 提供良好的科研環(huán)境，有機(jī)會發(fā)表文章、推薦到國內(nèi)外知名高校和科研單位深造學(xué)習(xí)。

四、申請方式

申請者請將個(gè)人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表、國內(nèi)外任職證明、個(gè)人最高學(xué)術(shù)水平成果、項(xiàng)目、專利證書和獎(jiǎng)勵(lì)等）、代表作、未來計(jì)劃和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：liuyuwen@caas.cn，并抄送至znkyjyz@163.com【快捷投遞：點(diǎn)擊下方“立即投遞/投遞簡歷”，即刻進(jìn)行職位報(bào)名】，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+崗位+高校人才網(wǎng)”。

應(yīng)聘者材料將嚴(yán)格保密，并在通過簡歷篩選者將安排面試，未進(jìn)入面試者，不再另行告知。

工作地點(diǎn)：深圳市大鵬新區(qū)布新路97號。

事業(yè)單位招聘信息標(biāo)簽：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所基因組所Yuwen Liu課題組高校教師招聘 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所基因組所Yuwen Liu課題組教師招